มีหน้าที่กำหนดนโยบาย และออกเกณฑ์เพื่อกำกับดูแลความมั่นคงของสถาบันการเงินและกำกับดูแลธุรกิจการเงินที่มีผลกระทบต่อประชาชนในวงกว้าง วิเคราะห์
และติดตามฐานะการดำเนินงานของระบบสถาบันการเงิน รวมถึงกำหนดนโยบายและกลยุทธ์ในการพัฒนาระบบสถาบันการเงิน
สนส. ประกอบด้วย 2 ฝ่ายงาน คือ
ฝ่ายนโยบายความเสี่ยง
มีหน้าที่กำหนดนโยบายและออกเกณฑ์การกำกับดูแลความมั่นคงของสถาบันการเงิน ทั้งด้านความเสี่ยง และธรรมภิบาล เพื่อยกระดับมาตรฐานการกำกับดูแล
ให้สอดคล้องกับมาตรฐานสากล นอกจากนี้ ยังกำหนดนโยบายและออกเกณฑ์การกำกับดูแลธุรกิจการเงินที่มีผลกระทบต่อประชาชนในวงกว้าง เช่น ธุรกิจบัตรเครดิต
ธุรกิจสินเชื่อส่วนบุคคล เป็นต้น
ฝ่ายกลยุทธ์สถาบันการเงิน
มีหน้าที่วิเคราะห์และติดตามฐานะการดำเนินงานของสถาบันการเงิน เพื่อดูแลความมั่นคงของระบบสถาบันการเงิน และกำหนดกลยุทธ์ในการพัฒนา
ระบบสถาบันการเงิน อาทิ แผนพัฒนาระบบสถาบันการเงิน และผลักดันให้มีการดำเนินการปรับปรุงกฎหมายสถาบันการเงิน นอกจากนี้ ยังกำหนดนโยบาย
การเจรจาเปิดตลาดภาคการธนาคารในเวที WTO และทวิภาคีต่าง ๆ ตลอดจนประสานความร่วมมือกับองค์กรระหว่างประเทศ หรือธนาคารกลางในต่างประเทศ
และส่งเสริมความน่าเชื่อถือในการกำกับดูแลสถาบันการเงิน