วัตถุประสงค์เพื่อคุ้มครองเงินฝากของผู้ฝากเงินในสถาบันการเงิน(สง.) โดยเรียกเก็บเงินจากสง.นำสะสมไว้ในกองทุนคุ้มครองเงินฝาก เพื่อจ่ายคืนผู้ฝากเงินเมื่อสง.นั้นถูกเพิกถอนใบอนุญาต รวมทั้งทำหน้าที่ติดตามฐานะ การดำเนินงานของสง. หากสง.ใดประสบปัญหา จะเข้าร่วมเป็นกรรมการควบคุมฯร่วมกับ ธปท. และเมื่อสง.ถูกเพิกถอนใบอนุญาตแล้ว สถาบันคุ้มครองเงินฝากจะทำหน้าที่จ่ายคืนเงินฝาก และชำระบัญชีสง.ที่ปิดกิจการต่อไป

การให้กู้ยืมหรือให้สินเชื่อของสถาบันการเงิน จำเป็นต้องมีข้อมูลเกี่ยวกับฐานะทางการเงินและประวัติการชำระหนี้ของลูกค้าอย่างเพียงพอว่า ลูกค้ารายนั้นมีประวัติอย่างไร และมีภาระหนี้อยู่กับสถาบันการเงินอื่นมากน้อยเพียงใด ที่ผ่านมา การให้กู้ยืมหรือให้สินเชื่อของสถาบันการเงินยังมีข้อมูลไม่ครบถ้วน ส่งผลให้เกิดหนี้ที่ไม่ก่อให้เกิดรายได้เพิ่มมากขึ้น ทำให้เกิดปัญหาความมั่นคงแก่สถาบันการเงินและระบบสถาบันการเงินโดยรวม

บริหารสินทรัพย์ด้อยคุณภาพของสถาบันการเงิน ปรับโครงสร้างหนี้ ปรับโครงสร้างกิจการ เพื่อประโยชน์แก่การฟื้นฟูเศรษฐกิจหรือความมั่นคงของประเทศ

ในช่วงที่ผ่านมา ประเทศไทยประสบปัญหาวิกฤตการณ์ทางเศรษฐกิจและระบบสถาบันการเงินอย่างรุนแรง อันมีผลกระทบต่อความมั่นใจและระบบการเงินของประเทศ รัฐบาลได้ดำเนินมาตรการต่างๆเพื่อแก้ไขวิกฤตการณ์ กองทุนเพื่อการฟื้นฟูและพัฒนาระบบสถาบันการเงิน เป็นหน่วยงานที่รับผิดชอบและรับภาระทางการเงินจนกระทั่งเกิดความเสียหายขึ้น จึงมีพ.ร.ก.ให้กระทรวงการคลังกู้เงินและจัดการเงินกู้เพื่อช่วยเหลือกองทุนฟื้นฟูฯ